为提高仪器的使用效率并使仪器操作简单化，操作者并不在仪器计算机上处理谱图，而是下载后自行处理。为防止病毒感染仪器计算机使系统遭到破坏并避免过多访问者拜访仪器计算机使其工作性能下降，取核磁样品文件需通过所里的服务器。服务器中的程序每隔半小时从仪器计算机中取核磁文件，文件的前3个字符为组长代码，程序识别出组后把文件放入服务器相应的组长目录下。样品的所有者通过所里局域网下载Fid文件后自己用NUTS软件进行傅立叶变换、积分、打印谱图等后期处理。
使用Mifare射频卡进行上机人员身份验证为避免未培训过的人上机对仪器造成损坏和有效的追踪仪器的使用状况，我所自行开发了一套开放仪器管理系统。开放仪器用所里考勤卡进行上机资格认证。所里的考勤卡为Mifare卡，是非接触式射频卡。整套仪器控制系统通过一台控制用计算机进行卡号采集，仪器使用控制与数据处理。平时控制计算机通过KVM切换器锁住仪器计算机的键盘和鼠标，需要的话也可控制显示器。当上机者在Mifare读卡器上打过卡后，读头把卡号传送到控制计算机，控制计算机把卡号与数据库中的信息进行对比，如符合上机资格，则为鼠标与键盘解锁，如不符合，则无效。
上机者做完试验再打一下卡，鼠标与键盘重又处于锁定状态。控制计算机把开始实验时间与结束实验时间记录于数据库中，如上机者在做完实验后忘记打卡，则把下一位上机者打卡上机的时间作为其结束时间，并在数据库中记录为其非正常退出。数据库按月出使用记录和使用时间的报表，各个课题组可通过网络对仪器使用状况进行查询。由于使用计算机RS232接口与Mifare读卡器进行通讯读入卡号，用IO卡对KVM切换器进行控制，故只需加一块串口扩展卡，就可实现对多台仪器进行控制。
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